Wheeljack, salah satu anggota Autobot tengah mencari sisa-sisa Energon, energi yang dibutuhkan untuk kelangsungan hidup makhluk Cybertron bersama dengan Bumblebee, robot yang bekerja sebagai ‘pemulung’ demi kelangsungan hidupnya. Namun, keduanya bertemu dengan The Seekers, pasukan udara milik Decepticon yang dipimpin oleh Jetfire.

Sementara The Seekers menahan kedua robot tersebut, Megatron yang muncul memutuskan untuk mengeksekusi lawannya. Namun, di saat-saat kritis Optimus Prime datang untuk menyelamatkan rekannya dan Bumblebee yang dikisahkan bukan, atau lebih tepatnya, belum bergabung bersama kubu dibawah kepemimpinan Optimus tersebut.

Saat kembali ke markas rahasia mereka, Optimus mendapat nasihat dari rekannya, Ultra Magnus untuk menghentikan konflik antara Autobot dan Decepticon mengingat planet mereka kini berada diambang kehancuran. Magnus yang merindukan perdamaian terjadi atas Cybertron kemudian memilih menyerahkan diri pada pihak Decepticon dengan maksud untuk berdialog dengan Megatron.

Hal tersebut justru membuat Magnus masuk dalam tahanan Decepticon yang sementara itu unggul dalam pertikaian kedua kubu. Shockwave, salah satu anggota Decepticon kemudian mengusulkan pada Megatron untuk menemukan The Allspark, sebuah objek legenda yang merupakan sumber kehidupan makhluk di Cybertron.