Di masa lalu, dua saudara kembar Rhian dan Rafal mendirikan Sekolah untuk Kebaikan dan Kejahatan demi mempersiapkan para siswanya untuk berpartisipasi dalam banyak kisah dongeng.

Dalam sebuah latih tanding, Rafal yang haus kekuasaan menyerang Rhian. Namun dengan ketangkasannya, Rhian berhasil selamat dari serangan Rafal yang tewas jatuh dari tebing.

Masa kini, desa Gavaldon. Sophie yang tampil seperti seorang putri bersahabat dengan Agatha yang dijuluki penyihir oleh warga. Seperti biasa, mereka berdua mencari buku baru untuk dibaca.

Sophie melihat lambang sekolah fantasi di halaman depan buku Cinderella. Secara diam-diam, Sophie menulis surat ke sekolah tersebut agar bisa pergi dari desanya.

Saat fenomena bulan darah terjadi, sesosok makhluk gaib menyeret Sophie yang segera dikejar oleh Agatha. Terlepas dari makhluk itu, mereka dibawa oleh seekor burung raksasa berbentuk kerangka ke Sekolah untuk Kebaikan dan Kejahatan.