Di dunia alternatif, pada tahun 1982, sebuah pesawat raksasa yang berasal dari luar angkasa tiba di bumi. Pesawat itu mengitari wilayah Afrika Selatan dan mendarat di Johannesburg. Sebuah tim diterjunkan untuk menginvestigasi apa yang berada di pesawat itu.

Ternyata ada lebih dari sejuta alien di dalam pesawat dengan kondisi malnutrisi dan kelaparan. Para alien itu dijuluki Prawns, panggilan deregatori yang menyamakan mereka dengan jangkrik.

Pemerintah Afrika Selatan membuat kebijakan yaitu memberi mereka kamp untuk hidup di District 9. Dalam jangka waktu beberapa tahun, wilayah itu berubah menjadi kumuh. Para penduduk lokal mulai mengeluhkan keberadaan alien yang hidupnya jorok, sering melanggar hukum, bahkan nggak jarang menyerang manusia.

Tensi yang memanas antara manusia dan alien membuat pemerintah mengontrak perusahaan swasta, Multinational United (MNU) untuk merelokasi alien dari wilayah kota. MNU merupakan perusahaan swasta yang bergerak di bidang pembuatan senjata.