Clay Jensen adalah seorang remaja berusia 17 tahun yang bersekolah di Liberty High School. Dia berkenalan dengan seorang murid baru bernama Hannah Baker. Perlahan-lahan Clay menyimpan perasaan pada Hannah tapi nggak diungkapkan. Suatu hari dia mendapatkan kabar mengejutkan. Hannah yang dikenalnya dinyatakan meninggal akibat bunuh diri.

Dua minggu setelah kematian Hannah, Clay yang pulang dari sekolah menemukan sebuah kotak misterius. Namanya tertulis di atas kotak tersebut. Ketika dibuka, ternyata kotak itu berisi kumpulan kaset. Merasa penasaran, dia langsung memutar sebuah kaset di tape milik ayahnya. Kaset itu berisi suara Hannah yang baru saja meninggal.

Dia menyampaikan 13 alasannya melakukan bunuh diri lewat kaset tape. Kaget karena kedatangan ibunya, Clay nggak sengaja merusak tape milik ayahnya. Dia kemudian mencuri walkman milik sahabatnya, Tony Padilla, supaya bisa mendengar kaset yang dia dapat satu per satu. Tony juga yang akan menemani Clay mendengarkan kaset-kaset tersebut. Lewat kaset itu, Hannah menceritakan berbagai pengalamannya dengan orang-orang yang dikenalnya di Liberty High School, dan kiranya siapa orang yang membuat dia memutuskan bunuh diri.